本病的乳头溢液可在挤压乳腺时而出，但更多者为自发性的。溢液可呈持续性，亦可呈间歇性，有些仅在内衣上留下棕黄色的污迹。多数病例不伴有疼痛，少数情况下，当肿瘤较大而阻塞输乳管时，可产生疼痛和肿块，而随着积血积液的排出，肿块会变小，疼痛也会得到不同程度的缓解。
由于导管内乳头状瘤的瘤体很小，所以多数情况下不能扪及，仅有少数患者可在乳头乳晕处发现肿块。肿块呈结节状或条索状，质地较软，轻轻按压时即可有血性或咖啡样液体自乳头溢出。多发性乳头状瘤的肿块则位于乳腺的边缘区域，边界不清，质地不均。
一般来讲，单发的大导管内乳头状瘤较易发生溢液;而多发的中小导管内乳头状瘤则溢液机会相对少一些。